המרכז הירושלמי לעל קול
וארבע מימד 
בהנהלת ד"ר עפר תדמור

 

אישור תור  |  איך מגיעים  |  הזמנת תור  |  



להצטרפות לרשימת התפוצה הכנס את כתובת הדואר האלקטרוני שלך:
 



בדיקת CGH (צ'יפ גנטי) לאבחון שינויים קטנים בכרומוזומים


 
בדיקה חדשנית, מהירה מאוד, לאבחון פגמים קטנים מאוד בכרומוזומים עצמם, אשר בבדיקות אחרות לרוב לא ניתן לזהות.

שמות נרדפים:

Chrimosomal Micro Array Analysis, CMA, Comparative Genomic Hybridization, בדיקת "צ'יפ גנטי".

מה ניתן לאבחן בבדיקת CGH?

בדיקת CGH (ראשי תיבות של Comparative Genomic Hybridization) מטרתה לאבחן פגמים קטנים מאוד בכרומוזומים של העובר, כאשר לרוב מתמקדים בבדיקה באיזורים ספציפיים שידוע כי פגמים בהם גורמים לתסמונות נפוצות.

להלן רשימה מורחבת של כלל התסמונות אותן ניתן לזהות באמעות השבב הגנומי:

 
gg   המעבדה הציטוגנטית - הדסה עין כרם
      רשימת התסמונות המזוהות באבחוןטרום לידתי על ידי השבב הגנומי
Chr Disorder CytoBand OMIM Genes Candidate genes
chr1 1p36 Microdeletion 1p36 607872    
chr1 1q21.1 Microdeletion with susceptibility for thrombocytopenia-absent radius (TAR) 1q21.1 274000    
chr1 1q21.1 Microdeletion with susceptibility to mental retardation, autism, or congenital anomalies * 1q21.1 612474   ACP6, GJA5, GJA8
chr1 1q41-q42 Microdeletion 1q41     DISP1
chr1 1q44 Microdeletion 1q44     AKT3
chr2 2p15-p16.1 Microdeletion 2p15-p16.1    
chr2 2p21 Microdeletion, homozygous 2p21 606407    
chr2 2q32.2-q33 Microdeletion 2q33.1 119540   SATB2
chr3 3q29 Microdeletion 3q29 609425    
chr6 6p25.3 Microdeletion 6p25.3      
chr6 6q24.3 Microdeletion 6q24.3      
chr7 7q11.23 Microduplication 7q11.23 609757    
chr8 8p23.1 Microdeletion 8p23.1     GATA4
chr9 9q22.32-q22.33 Microdeletion 9q22.33     TGFBR1
chr9 9q34 Microdeletion 9q34.3 610253   EHMT1
chr10 10q22.3-q23.31 Microdeletion 10q22.3-q23.31    
chr12 12q14.1-q15 Microdeletion 12q14.3     LEMD3, GRIP1
chr12 12q24.21-q24.23 Microduplication 12q24.21-q24.23    
chr14 14q11.2 Microdeletion 14q11.2     CHD8, SUPT164
chr14 14q22-q23 Microdeletion 14q22-q23 600037    
chr15 15q11-q13 Microduplication 15q11-q13 608636    
chr15 15q13.3 Microdeletion 15q13.3 612001   CHRNA7
chr15 15q24.1-q24.3 Microdeletion 15q24.1-q24.3    
chr16 16p11.2 Microdeletion 16p11.2 611913    
chr16 16p11.2-p12.2 Microdeletion 16p11.2-p12.2    
chr16 16p13.1 Microdeletion predisposing to autism and/or mental retardation 16p13.1      
chr16 16p13.3 Microdeletion/Severe Rubinstein-Taybi 16p13.3 610543 CREBBP, DNASE1
chr16 16q11.2-q12.2 Microdeletion 16q11.2-q12.2   SALL1, ZNF423
chr17 17q21.3 Microdeletion 17q21.3 610443   MAPT
chr22 22q11.2 Distal microdeletion 22q11.2 611867    
chr22 22q11.21 Microduplication 22q11.21 608363   TBX1
chr22 22q13.3 Microdeletion 22q13.3 606232   ARSA, SHANK3
chrX Xp11.22-linked mental retardation Xp11.22     HSD17B10, HUWE1
chrX Xp11.3 Microdeletion Xp11.3 300578   RP2, ZNF674
chrX Xp11.4-p21.2 Contiguous gene deletion Xp11.4-p21.2 , IL1RAPL1, OTC
chrX Adrenal hypoplasia congenita (AHC) Xp21.2 300200 NR0B1  
chr20 Alagille 20p12.2 118450 JAG1  
chr2 Albright hereditary osteodystrophy-like/Brachydactyly-MR 2q37.3 600430    
chr16 Alpha thalassemia mental retardation (ATR-16) 16p13.3 141750 HBA1  
chr16 Alpha thalassemia mental retardation (ATR-16) 16p13.3 141850 HBA2  
chrX Androgen insensitivity Xq12 300068 AR  
chr15 Angelman 15q11.2 105830 UBE3A  
chr11 Aniridia II 11p13 106210 PAX6  
chr5 Atrial septal defect (ASD) with atrioventricular conduction defects 5q35.2 108900 NKX2-5  
chr10 Bannayan-Riley-Ruvalcaba (BRRS) 10q23.31 153480 PTEN  
chr15 Bartter, antenatal 1 15q21.1 601678 SLC12A1  
chr11 Bartter, antenatal 2 11q24.3 241200 KCNJ1  
chr1 Bartter 3 (classic) 1p36.13 607364 CLCNKB  
chr1 Bartter 4 (infantile with sensorineural deafness) 1p32.3 602522 BSND  
chr1 Bartter 4 (infantile with sensorineural deafness) 1p36.13 602024 CLCNKA  
chr1 Bartter 4 (infantile with sensorineural deafness) 1p36 602023 CLCNKB  
chr9 Basal cell nevus/Gorlin-Goltz 9q22.32 109400 PTCH1  
chr11 Beckwith-Wiedemann, IGF2-related 11p15.5 130650 IGF2  
chr11 Beckwith-Wiedemann, KCNQ1OT1-related 11p15.5 130650 KCNQ1OT1
chr20 Benign neonatal epilepsy 20q13.33 121200 KCNQ2  
chr16 Bilateral frontoparietal polymicrogyria (BFPP) 16q13 606854 GPR56  
chr3 Blepharophimosis, ptosis epicanthus inversus (BPE) 3q22.3 110100 FOXL2  
chr5 Boston-type craniosynostosis 5q35.2 604757 MSX2  
chr8 Branchio-oto-renal (BOR)/Melnick-Fraser 8q13.3 113650 EYA1  
chr12 Buschke-Ollendorff 12q14.3 166700 LEMD3  
chr17 Campomelic dysplasia (CMPD) 17q24.3 114290 SOX9  
chr22 Cat-eye 22q11.1 115470    
chr9 Cerebellar hypoplasia, VLDLR-related/Hutterite dysequilibrium 9p24.2 224050 VLDLR  
chr7 Cerebral cavernous malformations, type 1 (CCM1) 7q21.2 116860 KRIT1  
chr7 Cerebral cavernous malformations, type 2 (CCM2) 7p13 603284 CCM2  
chr3 Cerebral cavernous malformations, type 3 (CCM3) 3q26.1 603285 PDCD10  

כיצד מתבצעת בדיקת CGH?

בניגוד לבדיקות שהיו נפוצות בעבר, בהן הבדיקה של הדגימה נעשתה תחת מיקרוסקופ, בדיקת CGH מבוססת על צביעה פלורסצנטית של דגימת חומר תורשתי (DNA) הנלקחת מהעובר הנבדק (למעשה ממי השפיר) והשוואתה אל מול דגימה של אדם בעל חומר תורשתי (DNA) נורמלי ותקין לחלוטין. הבדיקה עצמה אם כן, מתחילה בלקיחת דגימה קטנה של מי שפיר, על מנת לקבל דגימה של החומר התורשתי העוברי, וכן דגימה של חומר תורשתי תקין ונורמלי של אדם בריא. בשלב הבא צובעים בצבע פלורסצנטי אחד (ירוק) את הדגימה של העובר הנבדק ובצבע פלורסצנטי אחר (אדום) את דגימת הביקורת (של האדם הבריא). בשלב הבא מערבבים את שתי הדגימות על מצע זכוכית ומתבוננים.
 
  • כאשר כמות החומר התורשתי בכרומוזום מסויים שווה בשתי הדגימות – יתקבל צבע צהוב.
  • כאשר יש עודף של חומר תורשתי בכרומוזום של העובר על פני כרומוזום הביקורת – יתקבל צבע ירוק יותר.
  • כאשר יש חסר של חומר תורשתי בכרומוזום של העובר על פני כרומוזום הביקורת – יתקבל צבע אדום יותר.
כאמור, כאשר מדובר בבדיקת כרומוזומים עובריים על ידי דגימת מי שפיר, נהוג לבדוק מקטעי מסויימים בחומר התורשתי שידוע כי הם הגורם לתסמונות גנטיות מוכרות. זהו למעשה המקור לשם הבדיקה "בדיקת צ'יפ גנטי". צ'יפ הוא למעשה מעין לוח המכיל מקטעים מסויימים של החומר התורשתי אשר נבדקים בבדיקה. ישנם צ'יפים שונים, בהם המקטעים הנבדקים שונים, והבחירה בצ'יפ בהתאם לצרכים בבדיקה.


 


מתי מתקבלות התשובות?

מאחר שהבדיקה אינה דורשת גידול תרביות של התאים, ניתן לבצע אותה במהירות. התוצאות לרוב מתקבלות בפרק זמן של עד 10 ימי עבודה מרגע הגעת הדגימה אל המעבדה.


מהי עלות בדיקת ה CGH?

הבדיקה יחסית חדשה בשלב זה ואיננה קלה לביצוע, בנוסף החומרים הדרושים לה אינם זולים. בשל כך, מחירה של הבדיקה יקר יחסית, ונהוג לבצעה לאחר יעוץ גנטי.


היכן מתבצעת הבדיקה?

הבדיקה מתבצעת במכונים גנטיים לאחר קבלת יעוץ גנטי.


מהם יתרונות בדיקת ה CGH?

  1. זיהוי שינויים קטנים מאוד בכרומוזומים, אשר לא ניתן להבחין בהם בבדיקה במיקרוסקופ.
  2. מאפשרת לזהות מצב בו רק בחלק מהתאים מופיע פגם מסויים במבנה כרומוזום, זאת בניגוד לבדיקות אחרות, שם לא תמיד ניתן לזהות מצב זה.
     
  3. מהירה יחסית.

מהם החסרונות של בדיקת ה CGH?

  1. מאחר שמדובר בבדיקה חדשה יחסית, האנליזה עדיין אינה למודת ניסיון ויתכן שיתקבלו תוצאות שיפורשו באופן שגוי.
  2. לא ידוע עדיין עד כמה הבדיקה מועילה במקרים בהם לא התגלו ממצאים חריגים בסקירות המערכות. במקרים אלה המידע המתקבל מבדיקת CGH עשוי להיות מטעה ולגרום לדאגה שלא לצורך.
     
  3. מחירה של הבדיקה עודנו גבוה מאוד.
קישורים:
 
[חזרה למעלה]             [הוספה למועדפים]             [מפת האתר]
לייבסיטי - בניית אתרים